и все же как сделать сортировку по файлам ?

Говорится что не надо использовать винду

А чем вас не устраивают include/raquire ?

Я конечно не могу знать про что именно речь, но по-меоему всю жизнб в файле .INC хранились типа библиотеки PHP, набор функций и классов и т.д.

то бишь при нажатии на название файла или каталога оный и открывается

$fp = fopen($name,'r');

$data = fread($fp,filesize($name));

fclose($fp);

$this -> data[$nn] = $data;

$this -> da_vr[$nm] = $data;

создаю\получаю\формирую данные для вывода.

но я не знаю как мне результат передать на сервер?

Антивирусы ругаться не будут просто потому что на js такого невозможно реализовать, и ругаться им не на что будет