Используйте подход с пакетной обработкой.
Например, предварительно вычитать имеющиеся в таблице значения и затем сравнивать локально.
Или записывать во временную таблицу, затем одним запросом переписать строки.
Возможно, хватит банального insert on duplicate key update или insert ignore
|