20 000 запросов в минуту

3,5 Мб. текста через preg_match_all довольно быстро делятся на 20 000 строк (в пределах секунды) для обновления параметров в бд, все данные это цифры. Данные должны обновляться раз в минуту. Проблема в том, что обновление параметров идет крайне медленно... за минуту еле успевает обновится половина.
Не силен в настройке mysql сервера, может стоит что то там поковырять и выделить больше ресурсов (ЦП и память далеки от полной нагрузки)?

По хорошему то на редис или мемкеш перебросить все это и тогда бы проблема отвалилась, но пока так, как есть.

Apache-2.4+Nginx-1
PHP-5.6
MySQL-5.6
(Добавление)
если mysql в любом случае не сможет обработать хотя бы 1000, а лучше 2000 update в секунду на 5 чисел int, тогда буду менять концепцию... или все таки может?

Заключить в транзакцию? По идее должно обновляться быстрее.

-----
Чем больше узнаю, тем больше я не знаю.

И не по идее, а по факту. Пишите в одной транзакции.

Всосать 30тыс записей, сверить их с имеющимися данными в таблице, отчитаться на приложение о найденных аномалиях, смержить с таблицей, прогнать весь массив этих данных через реферальную программу, пересчитать ещё штуки 3 таблицы аггрегации - запросто. Всё перечисленное - 5 секунд реального времени.

-----
PostgreSQL DBA

Попробую, у меня в этом случае на это время блокируется таблица эта так? (структура Innodb)

у инны лочатся строки, у мисама вся таблица целиком

-----
Just do it

т.е. сделать селект устаревших данных прогнать аномалии и внести изменения через транзакцию как то так?

Это был пример с одного моего проекта, что mysql успевает сделать за 5 секунд и одну транзакцию.

-----
PostgreSQL DBA

И так сделал таймлаин и замерил скорость на разных этапах..
До оптимизации 1065 строк обновлял в пределах 12-13 секунд
С транзакцией 17-18к строк глотает за 4 секунды, всё круто спасибо... с учетом загрузки выборки и манипуляций за 8 секунд отработал - всё супер

PS: начал PDO вылетать с неизвестной ошибкой... заглянул в класс соединения и о боже заметил, что там для каждого запроса создается новый экземпляр PDO.. теперь всё ок