Вопрос такой есть таблица users есть ексел данные которые не много не соответсвуют первой таблице но кое какие поля совпадают.Всё это дело реализованно в компоненте поиска инстанс цмс.Возможно ли сделать компонента поиска так что бы он выполнял поиск обращаясь к двум таблицам?

Ужасно составлен вопрос =(
Где она есть? В html? В бд?
Что, все? Таблица реализована? Поиск реализован? Выгрузка в эксель реализована?
Судя по всему поиск в бд уже реализован. Вам осталось реализовать поиск в экселе. Прежде чем искать данные, документ нужно распарсить. Распарсить документ можно довольно легко, если предварительно конвертировать его в xml формат.

В случае если дифференциаця таблиц производится по набору дополнительных неключевых информационных полей - то для приведения их к требуемому виду возможно использование ALTER-запроса с добавление соответствующих столбцов и сохранения в них значений по-умолчанию