Есть сайт на Drupal 6
сервер на debian apache
на сайте происходила такая ситуация, можно было войти по трем типам домена: www, http: https, при этом для каждого входя создается отдельная сессия, и если мы зашли через www.site.ru, а потом перешли на site.ru(http://site.ru) то сессия рвется, точнее получается что мы только зашли.

Нужно как то это вылечить, что бы при переходе сессия не рвалась, чувствую, что это проблема настройки сервера
что делать?

На мой скромный взгляд, это ваш косяк. Как вам еще не вставили seoшники?
Сайт должен быть доступен по одному адресу.

А вот по поводу перехода с http на https здесь все таки полно расписано: http://stackoverflow[dot]com/questio[dot][dot][dot]-to-https-in-php