если в xml добавить тег, то на следующюю строку указатель не переходит, и продолжает писать на той же строке
как это исправить?

Если это simpleXML, то так задумано и исправить это средствами парсера нельзя

altermann
а если каким нибутдь образом прочитать файл(знаю что выйдет не то что надо) и если в строке два тега то перевести на следующюю стоку второй тег, и это вынести в функцию и использовать ее после сохранения xml файла?

Ну первое пришедшее в голову решение это можно считать файл в строку, и сделать str_replace('><', ">\n<", $filestring). Но получится без отступов.

altermann
ну xml нельзя прочтать в исходном виде.
я пробовал не получилось.

Я имел ввиду прочитать файл функцией file_get_contents() или fopen+fgets
Кстати если переносы очень нужны то используй DOM, он позволяет больше чем simple

altermann
dom
не знаю даже, а какие преимущества?

Если честно никогда не использовал, но знаю что он позволяет получить доступ ко всем элементам, и если не ошибаюсь даже между тегами, но он более ресурсоемкий.